Viendo el pantallazo puedo decirte que ibas por buen camino. Al parecer el programador, que en ese caso era otra placa arduino, había leído la firma del chip que deseabas programar y avisaba que no coincidía con el bootloader de la placa que querías instalarle.
¿Podrías indicar cual es el chip que quieres programar, y a que frecuencia lo deseas hacer funcionar? Por ejemplo, en mi chip dice ATMEGA168V-10PI.
El programador por puerto LPT que te haz hecho debería de funcionarte. Conecta tu programador al chip y en una ventana MSDOS ejecuta la siguiente instrucción:
avrdude -c dapa -P lpt1 -p m328 -v
dapa - Nombre del programador que estás utilizando.
lpt1 - Nombre del puerto.
m328 - Nombre del chip. Si es un Atmega168, entonces m168.
Esta instrucción te devuelve la firma del chip. Cuenta que fue lo que respondió avrdude.
¿ Haz instalado giveio ? Sin este driver avrdude no se podrá comunicarse con el puerto paralelo.
No esperes a tu nuevo programador, porque no lo necesitas. Arduino viene configurado para programar bootloaders con el programador por puerto paralelo que ya tienes hecho.
Suerte