Il Mini dovrebbe essere a 5V. A meno che quello che hai tu non abbia stampigliato 3V per un errore.
Che sigle leggi sui regolatori presenti sulla scheda?
Applicando una tensione di 9V come alimentazione, che cosa leggi dal pin 3V?
So di certo che esiste una versione di 3,3V del Arduino MINI PRO.
La differenza in quel caso é che lo stabilizzatore é per 3,3V e il quarzi/risonatore é per 8MHz.
Ciao Uwe