Moin Lorenz.
Also ich weiß nicht recht ob ich Dich richtig verstanden habe, aber vielleicht hilft Dir folgendes weiter:
Ich habe in einem Projekt das Ausgangs-PWM-Signal benutzt um Vorschaltgeräte von Leuchtstoffröhren zu dimmen. Diese brauchen ein 1-10V Signal. Dazu habe ich das PWM-Signal vom Arduino mit einem Op-Amp um Faktor zwei verstärkt (um auf 10V zu kommen) und anschließend mit einem RC-Glied "geglättet".
Schau Dir doch mal folgende Seite an. Wenn Du Dein PWM-Signal, wie dort beschrieben, in ein Analogsignal wandelst kannst Du es am analogen Eingang des Arduino einlesen und entsprechend weitere PWM-Ausgänge schalten.
Hoffe es ist das was Du suchst 
Lieben Gruß
Poldi