leo72:
Per quel poco che conta, con la toolchain Atmel 3.4.2 precompilata io su Linux non ho avuto nessun problema ne' ho dovuto sistemare nessun file.
Confermo pero' che la compilazione dei sorgenti e' alquanto problematica e non l'ho mai fatta, neanche per la precedente 3.4.1.
Vuoi dire che a te i moduli con progmem.h sotto linux compilano senza alcun problema ? 
Se è così ... uso la VM per installarmi Ubuntu e faccio le prove su quello ... 
Guglielmo