per il 2 c'è un ottimo esemio fornito sul sito.. però se non conosci i2c e SPI ti conviene prima farti un'idea osservando come si usano i sensori i2c e SPI su arduino, capisci la logica di comunicazione, e poi passi al STM32.
Per la prima domanda mai usato quell'ambiente, e per l'ultima non so, devo ancora passare ad analizzare i timer, ma anche lì tutti gli esempi SMT usano una funzione che setta il timer principale ad una certa frequenza, io modificando quel valore ottengo un iterrupt ogni microsecondo, però non mi piace come cosa, preferirei andare sul PWM con giusta frequenza e dutyCicle.