Arduino + Fuente de Poder PC

Si empleas el conector externo puedes usar 12 V + Ground (cable negro)
Si quieres usar 5V debes meterlos directametne al pin Vin. y usar ground (cable negro)
Otra opción, si no recuerdo mal, metes 12 V y en lugar de ground metes 5 V, de esa forma tienes +7V y así no se calentara tanto el regulador. (esto es usando el conector externo)