Du hast recht, das mit dem Reset hatte ich nicht bedacht.
Müßte das aber mit dem Arduino Uno mit dem ATmega8U2 bzw 16U2 anders funktionieren als es beim 2009 mit dem FT232 funktionierte?
Ich glaube, das funktioniert beim UNO ziemlich ähnlich wie beim 2009. Allerdings ist mir nicht ganz klar, was Du damit ansprechen wolltest. Die Beschaltung der Reset-Leitung ist sehr ähnlich, auch wenn sie sich im Detail unterscheidet.
Der Hardware-Reset lässt sich schon bewerkstelligen, allerdings nicht einfach mit einem Transistor. Aber ein 555 Timer sollte mehr als genügen. Wie gesagt, das setzt voraus, dass bei einem Reset des Arduino das Bluetooth-Modul nicht resetted wird und dass das relativ enge Timing der aktuellen Bootloader eingehalten werden kann.