Por lo que he leido por encima, la eos emplea un protocolo de comunicaciones PTP y la controlan con el arduino mandando el paquete adecuado de datos.
No veo que tengas que tener problema con ello, la unica pega es que te hace falta un USB host para comunicar con la camara, de eso el USB shield debe funcionar sin problemas.
No sabia la de problemas que teneis alli abajo para pedir cosas internacionales...
Una cosa, no se si con solo controlar el disparo te valdria ya que si es asi por ebay tienes por menos de 2 euros mandos infrarojos para la eos y siendo asi esto significa que la camara tiene un sensor infrarojo que igual podias aprovechar dependiendo, claro esta, de que funciones se pueden controlar por IR y si estas son las que buscas.
http://www.ebay.es/itm/Wireless-Shutter-Remote-Control-For-Canon-RC-1-EOS-450D-400D-350D-XT-Xti-/160688111193?pt=Camera_Camcorder_Remotes&hash=item2569c1fe59
Lo digo porque ponerle un led infrarojo al arduino te sale en centimos y no te haria falta el USB host que te va a salir una pasta...
Ahora... si quieres otras funciones ya me callo.
Un saludo