la millis()conta il numero di millisecondi a partire dall'accensione del chip. Perciò savli il suo valore quando inizia il ciclo, lo sottrai a tutte le altre volte che usi millis() ed hai ottenuto lo stesso identico risultato che ti aspettavi!
non capisco bene il tuo codice (usa i tag [ code] e [/ code], oltre che sistemare l'identazione) ma mi pare che fai già qualcosa di simile