niki77:
C:\avrdude -c usbasp -p atmega1284p -P usb -e -F
Prova specificando una velocità di comunicazione, tipo "-b 19200" come si fa con l'ArduinoISP. Magari abbassando il baudrate riesci a risolvere.
PS:
spero che il parametro "-F" tu lo abbia usato solo in questo caso. Non va mai usato normalmente perché in caso di una comunicazione imperfetta (e può capitare, chi ha programmato centinaia di chip può confermartelo) forzi la scrittura provocando spesso danni.