allora sulla seriale viaggiano al massimo baudrate/10 carattewrei al secondo. Quindi è mooolto lenta, se tu scrive e ti aspetti subito una risposta, può succedere che essa non sia stata ancora spedita! Non solo, ma lato PC può capitare che il messaggio finisca nella seriale HW, che lancoia un interrupt rilavato dal SO, che lo rilancia alla java visrtal maschine, che lo rilancia alla libreria, che rileva che c'è un carattere. nel frattempo tutto questo sistema potrebbe essere messo in pausa per eseguire altre cose in altri thread/processi, in uno scema più o meno complicato. certo parliamo di millisecondi, ma abbastanza per credere che non sia arrivata nessuna risposta.
Insomma è come se appena uno ti risponde al telefono gli dici "ciaocomestai?" e poi metti giù. E' raro che lui faccia in tempo a risponderti, però alla volte succede.
Oh, poi non ho letto il tuo codice ma gli ho dato uno sguardo veloce,magari ci sono altri errori