Yo tengo el de Atmel que aproveché para pedir a digikey una vez que tenía que pedir más cosas, por lo que los clones no los he usado, a gente que los ha usado si he visto que les ha dado problemas alguno con el AVR Studio.
El clon que funciona y que conozco a 3 personas que lo están usado sin problema creo que es este: http://www.sureelectronics.net/goods.php?id=982 (voy a preguntarlo y lo confirmo) , de si funciona con MAC no sé decirte, ya que nunca he utilizado uno, por aquí varia gente usa MAC (en las reuniones de talleres de Arduino que he visto el 80% de los pcs que lleva la gente son MAC :?), así que supongo que alguien por aquí sabrá decirte que opciones hay de programadores para estos pcs.
Si te quieres dedicar a la electrónica te recomiendo que pases de Arduino y uses el avr-gcc y las librerías directamente, a no ser que quieras participar en el desarrollo de éste. Si quieres hacer un proyecto lo antes posible pues si usa Arduino, todo depende al nivel que quieras entrar.