Bootloader e programmatore per Arduino

In quanto al PL2303 ne sono a conoscenza, infatti ho dovuto cercare i driver appositi per farlo funzionare e devo dire che ne sono soddisfatto, in quanto con questo chip serve pochissimo tempo per caricare uno sketch confronto all FTDI a cui ero abituato con l'arduino duemilanove; la mia domanda forse celava un velo di ignoranza in materia, forse è meglio riformularla così: che differenze ci sono tra il bootloader della duemilanove e quella dell'uno r3?

per quanto riguarda il software era per provare qualcosa di diverso, non perchè non mi piaccia l'IDE ufficiale, solamente per provare qualche altra opzione che magari risultasse più comoda o versatile.

infine riguardo alla eprom, dato che ne avevo trovate diverse in una scatola dimenticata in garage mi chiedevo se potessi riutilizzarli in un qualche modo, come se fosse un arduino un po' anziano ma che potesse svolgere qualche semplice operazione, potendolo programmare senza dover spendere centinaia di euro per un programmatore eprom...