Capacité d'une arduino Mega ?

Si le compteur consomme pas trop je ne vois pas de problème.

125 mA pour l'émission radio ?? Tu veux émettre depuis mars toi ^^ Les module RF consomment en général autour des 10-20 mA en émission.

Pour l'alimentation autonome, le plus simple reste la pile 9V que tu branche sur le jack. Pas cher, je viens de regarder vite fait la capacité d'une pile rechargeable elle font ~200mAh donc si ton montage consomme dans les 100 mA, tu as tes deux heures. Et en plus tu peux facilement la changer en cours de route.