Si, se pueden usar para finales de recorrido, para hacer un teclado, para controlar un relé o un FET. Realmente para lo que se quiera.
He sacado las entradas salidas analógicas porque son mucho más versátiles que las discretas. Con un solo pin se puede hacer un teclado de unos 5 botones sin grandes problemas, conectar 3 detectores de final de recorrido, ... También se pueden usar como salidas: controlar un FET - posicionamiento laser, encendido apagado del motor de la fresadora, ...