Piccolo Problema..

e per toglere ogni dubbo il Atmega va inserito nel Arduino con la scritta al rovescio e la tacca a destra. Vedi foto http://arduino.cc/en/Main/ArduinoBoardUno

Per quello maltrattato. Dipende quali piedini hai spezzato potrebbe ancora funzionare ma alcuni Pin non averli piú disponibili. Se quelli rotti non sono Reset, l' alimentazione, massa, Vref, X1 e X2 e Pin 0 e Pin 1 dovresti ancora poterlo usare per certe cose.
Ciao Uwe