6V ist das absolute Maximum was der Chip kann. Wenn der Spannungsregler auf dem Board kaputt ist, dann nützt Dir das Vin Pin nix. Wenn dann 5V erzeugen und auf der 5V Pin geben.
Es gibt glaub ich genaus soviele Meinungen wie der 7805 zu beschalten ist, wie es Seiten dazu im Netz gibt. Wichtig sind die beiden 100nF Kerkos so nahe wie möglich an Vin und GND, bzw. Vout und GND, damit der Regler nicht schwingt. Ein Elko am Eingang puffert eine unregelmäßige Eingangsspannung und ein zusätzlicher Elko am Ausgang hält die Spannung für den Arduino bei möglichen Lastwechseln stabil.