Où as tu vu que la nano n'est plus fabriquée ?
Elle est toujours au catalogue officiel Arduino et disponible sur Ebay.
Si c'est un problème de place je persiste le mieux, si tu n'as pas besoin de la liaison USB en permanence, c'est une mini-pro (35mm x 20mm) et cerise sur le gâteau tu économise la consommation de l'interface USB, même si ce n'est que quelques mA c'est toujours ça de pris.
Pour la programmation voir le tuto de Jean-Marie : c'est un long fil très complet on ne fait pas mieux.
Edit nano : 43 mm x 19mm