Schritt 1: In der IDE unter Filer -> Preference "show verbose output during upload" ankreuzen und die detailierte Fehlermeldung posten. Danach kann man schon eher sagen wo das Problem liegt. Und wenn Du den anderen "verbose" Haken auch noch ankreutzt, dann siehst Du auch sofort was in welchen Verzeichnisen los ist.
Und wenn Du es wirklich ganz genau wissen willst: in meinem Buch gibt es ein Kapitel "hinter den Kulissen", da trete ich das richtig breit 