Pues si consigues arreglarlo,agradecería que lo pusieras por aquí, porque yo no lo he conseguido.
La única solución que vi es usar arduino en otro pc que tengo con windows, lo cual me parece la solución mas cobarde y cómoda, pero acabé frustrado, porque me maté a buscar y no conseguí nada.
Mi S.O es Ubuntu 10.04 Lucid. Y el Arduino 1.0. Lo dicho, funcionaba perfectamente, hasta que un día, no.