Il y a plusieurs possibilités.
Tu peux par exemple initialiser un compteur. Tu incrémentes ce compteur à chaque fois que tu lis un ";".
En fonction de la valeur du compteur, tu sauvegardes dans une variable (de type char) différente, ou dans un tableau à 2 dimensions. (n'oublie pas de réinitialiser les valeurs de ces variables entre 2 boucles)
Ensuite, tu peux transformer la valeur de type char en int en faisant quelque chose du genre:
int var_int=atoi(var_char)
Pour transformer un char en byte, je ne connais que:
byte var_byte=(byte) atoi(var_char)
mais il y a peut-être plus simple ...