Eh si, stavo giusto leggendo questi operatori e ora me li studio e provo un po' 
quindi posso adoperare queste porte nel file optiboot.c no?
Supponiamo che usi il pin 2 pensavo di fare così:
per impostare il pin come output DDRD |=B0000100
nella parte di trasmissione PORTD |=B0000100
nella parte di ricezione PORTD &=B1111011