A solução depende de em que ponto do processo você pretende efetuar a contagem, de como o mecanismo da máquina funciona, a velocidade em que os copos são agrupados.
Por exemplo, você pode usar um sensor de peso como ja foi citado a cima, ou um sensor como um laser para detectar a passagem de cada copo antes de serem alinhados para serem ensacados, depende muito do processo da máquina que manipula os copos pra que você saiba em que momento vai poder efetuar a contagem e ai sim decidir como fará isso.