Seu objetivo é medir frequência.
Uma onda de 1Khz com duty cycle de 10% produz uma tensão de 0,5 Volts, por exemplo, ao passar por um RC.
Uma onda de 1Khz com duty cycle de 90% produz uma tensão de 4 Volts, por exemplo, ao passar por um RC.
Ou seja você consegue saber o duty cycle mas não a frequência.
Edson