Per la questione del raffreddamento io la prima domanda che mi porrei e' se serve davvero. Arduino e componentistica non scaldano, e un aplificatore cosi' piccolo puo' scaldare proprio poco.
Io possiedo un sistema di amplificatori e computer in macchina, dove riesci ad utilizzare tutto senza ventole anche se hai 50 gradi...
Se tuttavia vuoi percorrere questa strada io ho fatto cosi: sensore di temperatura e ventole tipo da computer pilotabili via PWM (quelle nuove a 4 fili). Puoi fare una relazione tra la temperatura e la frequenza di pwm per variare la velocita' della ventola.
Ho comunque il sospetto che non ti servirà.