Antes de mais...
Um botão de paragem de emergência. Uma filosofia que permita a paragem imediata da máquina de forma segura. Isto é a primeira coisa que tens de pensar.
Depois protecções para ninguém meter os dedos perto da guilhotina. Não sei onde isto vai ser usado, mas a segurança de todos deve estar em primeiro lugar.
Uma fonte de alimentação para tudo isto...
Qual é o tipo do motor de passo?
Dependendo disso, tens de encontrar um driver para ele. Dependendo do driver que encontrares, podes então calcular os pinos que vais precisar para o mover.
O processador, provavelmente seja melhor pegares num Mega uma vez que o LCD leva logo 6 pinos. Um shield LCD talvez seja o ideal.
Vais talvez precisar dum encoder para os motores, ou fim de curso para teres pelo menos uma posição conhecida para a máquina começar. Por isso terás de comprar dois switches de fim de curso e umas resistências.
Um relé para a electroválvula (qual é a tensão para a electroválvula?).