Je ne comprend pas ta dernière remarque.
Le composant W5100 utilisé tant sur l'Aduino Ethernet (ethernet on-board) ou sur le shield Ethernet à besoin de la liaison SPI.
La liaison SPI en tant que telle n'a pas besoin de timer mais la gestion TCP/IP en à peut être besoin.
Quel lien fais-tu exactement entre SPI et timer et avec le problème ?