I buffer di cui si parla sono solo quelli SW, cioè gli array creati e gestiti da HardwareSerial.cpp e .h.
Come buffer hardware l'Atmega328 ha 2 registri e basta. Il primo è un registro a scorrimento in cui viene composto il dato man mano che arrivano i suoi bit. Una volta che è stata completata la ricezione il dato viene copiato in un altro registro, da cui il codice può leggerlo. Quando viene copiato in questo secondo registro, viene attivato un interrupt di ricezione terminata e dato pronto. E' a questo punto che scatta la ISR, che preleva il byte e lo copia nel buffer SW di cui stiamo parlando.