Ma perché utilizzate Arduino nei vostri progetti finiti?
Una volta scritto il programma sarebbe meno costoso, ingombrante e complicato trasferire tutto su ATMega e costruirgli attorno il circuito.
Pensa se ti parte un jumper e devi smontare tutto: se saldi il circuito completo (ATMega + periferiche) su di una scheda non hai questi problemi.
Se il problema è lo shield, puoi ricostruirtelo sulla stessa scheda dove monti il circuito "principale" 
Ad ogni modo, se la lamiera conduce, dovrai isolarla. Puoi farlo con due/tre fogli di plastica per alimenti (più economico) oppure con i lucidi per le proiezioni (più ordinato).
Pulisci bene la lamiera con la lana di ferro, applichi una colla tipo Artiglio, ci metti sopra il lucido e lasci a seccare al sole (o sotto una lampada).
Visto che non ho mai dovuto incollare una board su un pezzo di lamiera trattato in questo modo, da qui in avanti non saprei aiutarti.
Qualcuno ha detto "colla a caldo"... sembra una scelta sensata