La lib IRremote usa il timer 2, quindi non si può usare il PWM sul pin 11. Inoltre usa il pin 3 come pin di trasmissione.
Se puoi, sposta i led sugli altri 4 pin PWM collegati ai timer 0 e 1.
Esiste un file, IRremoteInt.h, dove puoi cambiare il timer usato dalla lib e spostarla sul timer 1.
Però così poi perdi il PWM sul pin 9 ed inoltre il pin 10 diventa il TX della lib.