Tens uma forma rapida para usar mais ficheiros no projecto usando a IDE do arduino.Se reparares abaixo de onde abres a porta Serie na IDE tens uma seta para baixo, tocas ai e escolhes new tab.De seguida pede-te o nome do ficheiro, colocas o que quiseres com a extensao desejada .h ou .c
Assim desta forma consegues ver todos os ficheiros envolvidos no sketch e ir alterando-os conforme precisas.
Quando fazes guardar ele vai colocar esses ficheiros na mesma pasta do projecto.
Quando abrires novamente o projecto ele tambem irá abrir os ficheiros adicionais.
No final quando tiveres tudo como desejas podes entao colocar isso tudo ( o ficheiro de cabeçalho .h e o ficheiro de implementaçao .c) numa liblioteca para reutilizares de futuro, bastando depois incluir essa biblioteca no projecto.
Anexei uma foto para veres as abas em cima com dois ficheiros de exemplo
