Spontan würde mir da einfallen die SD karte über SPI auszulsen (über ein Shield oder wie auch immer) dann über den Arduino mit Serial auf den Serielenport an den rechner, welche die Daten mit einem (wahrscheinlich selbst geschrieben Programm) annimmt und verarbeitet.
Noch mal die Zusammenfassung:
SPI Seriel
SD Shield ------> Arduino -------> Rechner
Gruß cr0n0s1