Standalone vuol dire che compri un micro ATmega328P e lo monti con la componentistica strettamente necessaria per fare quello che ti serve.
Esempio di StandAlone su BreadBoard:
Da qual che ho capito tu vuoi usare semplicemente Arduino non connesso al PC, in quel caso serve un'alimentazione esterna di almeno 7V 500mA e ovviamente non puoi verificare eventuali messaggi su Serial Monitor.
Se invece hai un micro standalone e lo vuoi programmare segui la guida del Prof. --> http://www.michelemenniti.it/arduino_burn_bootloader.php