Lo bueno de la matriz es que los leds ya estan ordenados, el cubo cuanto más grande.... más trabajo. A mi me gustaría hacer el de 8x8x8, pero será cuando tenga tiempo. A mi me ha venido bien para comprobar los pines.
Para mi caso he usado dos matrices, una para definir las filas y otra las columnas.
int fila[8] = {A5,A2,2,5,0,3,6,9}
int columna[8] = {A4,A1,11,12,1,4,7,10}
Terraguea, yo he definido los pines analógicos como A5,A2....