No entiendo muy bien qué quieres hacer exactamente. Yo inicializaría los 2 sensores y tomaría medida de ambos y sacaría la media (esto además te va a servir para pequeños errores de medida). Antes de realizar la media comprobar que la medida no es el error que dices que da si no esta operando y si uno de los dos da error sacar solo la temperatura medida por el otro.
Si lo quieres hacer un poco más "inteligente" puedes ir guardando en un vector los datos de cada sensor (las ultima x mediciones) y si de repente un dato varía solo en uno de los sensores y tiene una desviación muy grande respecto a los valores que estaba dando anteriormente el sensor puedes suponer que ha habido algún tipo de error, si ya te varían los dos en la misma medida entonces no porque es algo que ha hecho subir o bajar drásticamente la temperatura, las coincidencias no existen, ya lo decía grison.
Espera haberte dado una idea de por donde tirar.
Un saludo!