combie:
Was passiert wenn die Analog Referenz auf 1,1V gestellt wird?
Ja, das darf man natürlich nicht machen. Schon ein normales analogRead() ohne vorher die Referenz auf extern zu schalten nicht (wobei nichts passieren sollte wenn beide die gleiche 5V Quelle sind). Steht hier auch klar:
http://www.arduino.cc/en/Reference/AnalogReference
Wenn man sich das Blockschaltbild des ADCs ansieht wird klar wieso.