ok, si sabes crear bases de datos y tablas vamos bien
sabes php? sabes hacer un INSERT a la base de datos desde php?
lo que tienes que hacer es que arduino llame a un archivo php y le pase los parametros que tienes en variables del arduino
ejemplo
www.tupaginaweb.com/subirdatos.php?dato1=variable1&dato2=variable2
el php hace un GET
$rawdata = $_GET['dato1'];
y luego el mysql insert