Ciao,
grazie mille, sono riuscito a creare il file hex corrispondente a atmega88.
A questo punto, se ho ben capito, basta che io vada a creare una board virtuale con una cosa del genere nel file boards.txt
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atmega88.name=Arduino Giovanniw/ atmega88
atmega88.upload.protocol=arduino
atmega88.upload.maximum_size=6144 <<<<< grazie Michele!!!
atmega88.upload.speed=57600atmega88.bootloader.low_fuses=0xFF <<<<< Questi due mi sa che mi serve il datasheet
atmega88.bootloader.high_fuses=0xDA <<<<<
atmega88.bootloader.extended_fuses=0x05
atmega88.bootloader.path=atmega
atmega88.bootloader.file=optiboot_atmega88.hex <<<<< Ovviamente questo dopo aver copiato il file creato dalla build in atmega
atmega88.bootloader.unlock_bits=0x3F <<<<< Questi due mi sa che mi serve il datasheet
atmega88.bootloader.lock_bits=0x0F <<<<<atmega88.build.mcu=atmega88p <<<<< o atmega88?!?!?
atmega88.build.f_cpu=16000000L
atmega88.build.core=arduino
atmega88.build.variant=standard
e a quel punto il più dovrebbe essere fatto.
Puoi mica confermarmi che non ci siano grossolani errori in quanto ho scritto?
Non è impossibile che non padroneggiando Arduino abbia preso un palo...
Perdona se faccio domande cui, con un rapido test su scheda, potrei rispondere da solo, ma non ho ancora la scheda e la curiosità è tanta 
Grazie ancora e buon week end.
Giovanni