Hola riscking
Creo que con un condensador no tendrás potencia suficiente para llevar el motor a una posición concreta.
Tal vez podrías hacer lo siguiente:
Poner un pulsador de marcha, que alimente el arduino en paralelo con los contactos de un relé, de forma que al pulsarlo, se alimente al Arduino, y éste active el relé de alimentación (necesitarás mantener pulsado este pulsador durante unos segundos), y sea ya éste el que mantenga alimentado el arduino.
Con un pulsador de paro en otra entrada del Arduino, cuando lo pulses, mandas el motor a la posición de reposo, y después desactivas el relé, de forma que desactive la alimentación, y se desconecte el arduino
Saludos.