Ciao non credo, a meno che non sia necessaria la comunicazione seriale per il funzionamento, tipo trasferimento dati. Se la usi solo per vedere dei risultati sul serial monitor non da alcun problema. Per le read c'è l'apposito "if(availiable>0)" che controlla se la seriale è disponibile per cui tutto ciò che c'è dentro la if non viene eseguito in caso di non collegamento.
La domanda più che altro è : se non ti serve una comunicazione seriale perchè mettere codice inutilizzato su arduino?