du könntest auch mit einem Temperatursensor den du auf den Arduino setzt die Oberflächentemperatur des Controllers messen und bei Überschreitung einer Grenztemperatur einen Lüfter einschalten, falls Platz und geeignete Luftzufuhr das zulassen. Wäre vielleicht eine übertriebene Art, aber sollten bei einem Reset die Messdaten verloren gehen wäre Kühlkörper oder eben der Lüfter vielleicht eine bessere Alternative... ich weiß ja nicht wo der Arduino läuft in welcher Umgebung 
Gruß,
Tobi