A maneira mais simples será ligar o T1 (não o T0 por causa do millis), a um pino externo para usar esse temporizador como contador de eventos.
Depois criar uma interrupcão do T1 de 256 em 256, ou como este é um timer de 16 bits de 65000 em 65000 e quando essa interrupcão se der, ver quanto tempo passou desde a última.
Pode fazer-se ao contrário e de x em x tempo ver quantas contagens tens e fazer as contas a partir daí.