Am USB Port kannst du soweit ich weiß bis 500mA dem Arduino entnehmen (abzüglich der internen Schalktreise). Das sollte mit deinen LEDs soweit gehen. Du belastet in diesem Fall ja nicht die Ausgänge.
Bei 3 Leds sind das max. 180mA (3x 3x 20mA). Der max Fall wäre, wenn du die 3 Leds alle weiß leuchten lassen würdest.
Dürfte somit unproblematisch werden. Ich denke, dass in deinem Fall < 100mA sein wird. Kommt halt auf die Farbverwendung an.