Wie wäre es, wenn du dich dann daran hälst?
Den richtigen Ordner findest du in der Arduino IDE unter File/Preferences.
Eigene Bibliotheken kommen unter Linux wie bei Windows in den Ordner "libraries" in deinem Benutzerordner. Sieh mal in den Einstellungen nach, welcher Ordner deine Arduino Projekte beinhaltet. Das könnte ~/sketchbook sein. Dann gehören die Bibliotheken in ~/sketchbook/libraries.
Nur weil man bei Windows seine Dateien quer über das System verstreut hält, heißt das nicht, dass das unter anderen Betriebssystemen genau so geht.