So, ich habe das Problem gelöst, wenn auch ich den "Fehler" nicht gefunden habe:
Naja, das Problem ist damit nicht gelöst, sondern nur umgangen...
Bin ich in dem Modus, in der der PIN12 GND liefern soll, wartet das Hauptprogramm auf eine Tasteneingabe vom PC, bevor die eigentliche Operation beginnt.
Solange dies geschieht, verhält sich der Output wie ein PWM und gibt 4,6 V aus.
Dumm nur, dass Pin 12 kein PWM-Pin ist. Daher biete ich es dir nochmal an: Zeig deinen Sketch und die Beschaltung, ich bin mir ziemlich sicher, dass da der Fehler steckt.