Naja, grundsätzlich schaut man sowas hier:
http://www.atmel.com/dyn/resources/prod_documents/doc8025.pdf.
Die interessanten Stellen sind:
15.11.2 TCCR1B – Timer/Counter1 Control Register B
Bit 2:0 – CS12:0: Clock Select
The three Clock Select bits select the clock source to be used by the Timer/Counter, see Figure
15-10 and Figure 15-11.
16.3 External Clock Source
An external clock source applied to the T1/T0 pin can be used as Timer/Counter clock
...
An external clock source can not be prescaled.
17.11.8 ASSR – Asynchronous Status Register
Bit 6 – EXCLK: Enable External Clock Input
When EXCLK is written to one, and asynchronous clock is selected, the external clock input buf-
fer is enabled and an external clock can be input on Timer Oscillator 1 (TOSC1) pin instead of a
32 kHz crystal. Writing to EXCLK should be done before asynchronous operation is selected.
Note that the crystal Oscillator will only run when this bit is zero.
Bit 5 – AS2: Asynchronous Timer/Counter2
When AS2 is written to zero, Timer/Counter2 is clocked from the I/O clock, clkI/O. When AS2 is
written to one, Timer/Counter2 is clocked from a crystal Oscillator connected to the Timer Oscil-
lator 1 (TOSC1) pin. When the value of AS2 is changed, the contents of TCNT2, OCR2A,
OCR2B, TCCR2A and TCCR2B might be corrupted.
Du stellst also einen der Timer 1 oder 2 auf "external clock source" ein. Dann stellt Du den anderen Timer ein als PWM mit 50% Duty cycle und generierst damit den Takt für den anderen Timer der dann das eigentliche PWM generieren soll. Die Idee ist, daß damit einer der beiden Timer als Vorteiler arbeiten kann. Vermutlich ist es sogar besser Timer2 als Taktgenerator zu nehmen weil der Vorteiler unabhängig von Timer0 und 1 ist. Dann den Output von Timer2 in Timer1 als externen Takt und Timer1 für PWM konfigurieren.
Im Datenblatt ist das sehr ausführlich beschrieben. Man muss es sich nur einmal von vorne bis hinten durchlesen. Da steht auch genau wie man die Register setzen muß damit die gewünschte Frequenz rauskommt.
Ich würde so vorgehen, daß ich zunächst mal die Frequenzen ausrechne. Dann würde ich Timer 2 konfigurieren und schauen ob er tut wie er soll. Dann den Output mit dem Input von Timer 1 verbinden (Pins auch entsprechend als Input/Output konfigurieren) und schauen ob Timer 1 wie gewünscht läuft. Dann Timer 1 PWM Output konfigurieren und schauen ob es rauskommt wie es soll.
Hilfreich ist es auf den Arduino Kontakten dir "richtigen" Atmel Pin Bezeichnungen drauf zu schreiben damit man nicht dauern suchen muß.
Gruß, Udo