Hallo,
MProg ist ein Windows Programm zur Programmierung des EPROMs auf dem FTDI Chip. ->
http://www.ftdichip.com/Support/Utilities.htm#FT_ProgAber wafür sollte man das brauchen? Der FTDI Chip sollte ja bereits programmiert sein.
Unter Ubuntu gibt es die Arduino IDE als Paket über die SW-Verteilung.
Die einzige Frage, die bleibt: wie wird der FTDI Chip unter Linux erkannt. Bietet dir die IDE einen Port an unter Tolls->Serial Port? Falls nicht, poste bitte mal die Euinträge im syslog, wenn du das Board über USB mit Linux verbindest.
Gruß
Reinhard
Nachtrag:
http://www.linux-community.de/Internal/Artikel/Print-Artikel/LinuxUser/2011/02/Arduino-Lernpaket-von-Franzis. Dem ist nichts hinzuzufügen.