Hi,
Adjunto un link que explica como hacerlo. Lo unico que es en ingles. Lo que tienes que hacer es de leer la temperatura donde estan los terminales que conectas los cables de thermocouple. Le restas esa temperatura a la lectura que lees del thermocouple y ya tiene la temperatura verdadera. Puedes usar un LM35 para leer la temperatura ambiental donde conectas el thermocouple. El max6675 lo hace internamente.