Nein, nicht für den Basiswiderstand des Transistors, der hängt doch weiter am 5V Pin des Arduino. Lediglich die 9V für die LEDs kommen aus dem Vin. Dabei jedoch aufpassen, solltest Du mal ein anderes Netzteil verwenden, liegt natürlich dessen Ausgangsspannung an Vin an. (z.B. 12V bei einem 12V Netzteil).