Scusami la domanda, ma perchè invece di un encoder non usi un potenziometro e mediante partitore resistivo ti leggi una tensione ad es. variabile da 0 a 2,5V così anche se salta il mondo, la resistenza impostata sul potenziometro non cambia e al riavvio rileggi esattamente la tensione pre catastrofe ...
Cioè il controllo da digitale lo fai diventare analogico.